Le projet d'ALEA est en rupture complète avec les principes de multifonctionnalité de l'agriculture exprimés dans la Constitution (art. 104). La  recherche de la compétitivité calculée uniquement en rapport au prix des produits mis sur le marché est un point de vue réducteur. L'efficacité de la maximisation de la production au coût le plus bas pourrait conduire l'agriculture à une grande crise d'ici 20 ou 30 ans. En Suisse, les mesures de protection tarifaire n'ont rien d'excessif en regard des protections, certes de nature différente, dont bénéficient par exemple les secteurs bancaire ou pharma. Le maintien d'un certain niveau de protectionnisme est seul en mesure de garantir une agriculture multifonctionnelle. Pour Prométerre, ce projet d'accord de libre-échange agricole avec l'UE est caractéristique d'objectifs politiques anachroniques.